Kao i u ostalim gradovima na Primorju, u Herceg Novom vlada blaga mediteranska klima; sa suvim i toplim ljetima i blagim zimama. Ipak, Herceg Novi u pogledu klime ima i neke posebnosti, to je specificna mikro klima uslovljena juznom ekspozicijom, krecnjackom podlogom i planinskim zaledjem sto sprecava prodor hladne vazdusne mase. Te cinjenice ukazuju da je prosjecna godisnja temperatura u gradu izuzetno povoljna i iznosi 16 ,2 stepena Celzijusovih, sa preko 200 suncanih dana u godini. U ljetnjim mjesecima ( jul, avgust) grad ima oko 10,7 suncanih sati dnevno. Temperatutra mora kod Herceg Novog tokom ljeta iznosi 22 do 26 stepeni i uz priblizno istu dnvenu temperaturu vazduha omogucava kupalisnu sezonu koja traje i do 5 mjeseci. U Hereceg Novom i okolini duvaju i karakteristicni vjetrovi poput: zapadnog, ljetnjeg vjetra – maestrala; zimskog, sjevernog – bure; zimskog, juznog vjetra-juga , a sporadicno duvaju i ostali vjetrovi poput levanta, tramontane...
Flora je posebno interesantna, jer u gradu i okruzenju raste nekoliko stotina raznih biljnih vrsta iz svih krajeva svijeta. U Herceg Novom raste rijetko cvijece i ukrasno bilje. Najljepsi je prirodni park Savinska dubrava sa spomenicima iz ranije i novije istorije ovog kraja. U njemu i okolini najrasprostranjenija je mimoza (accacia decurrens, lat.) cvijet - zute boje. Mimoza je australijskog porijekla, a potice iz roda akacija. U Boku Kotorsku, odnosno Herceg Novi mimozu su donijeli pocetkom XX vijeka pomorci. Prema procjenama , u Boki danas ima 5.000 stabala mimoze. Na hercegnovskoj rivijeri uspijeva i magnolija ( magnolia grandiflora, lat.) Zimzeleno drvo prelijepih ljubicasto-bijelih cvjetova doneseno iz Sjeverne Amerike. U Herceg Novom se uzgaja i cikas palma (cycas revoluta, la t.) Veoma je popularna na Mediteranu, porijeklom je sa dalekog Istoka, jedna je od najstarijih zivih vrsta na svijetu. Agava (agave americana, lat.) je jos jedna interesantna biljka, cija je postojbina istocni Meksiko. Na tle Herceg Novog donijeli su je Spanci sredinom XVI vijeka. Agava ima antispeticka i ljekovita svojstva . Poznate biljke su i i lavanda (lavendula officinalis, lat.), planika (arbutus unedo, lat.), bogumila (bougainvillea spectabilis, lat.,)…
Obala Herceg Novog, a posebno njegovo zaledje bogato je i faunom. Osim raznih vrsta ptica, kao sto su laste, galebovi, sokolovi, sitnije ptice – crvendaci, vrapci, u podneblju i brdima oko Herceg Novog, cesto se srecu i zecevi, lisice, vukovi, divlje svinje, kune, vjeverice...